國家醫療奉獻獎
為肯定並獎勵獻身醫療界、不辭勞苦的醫事、護理及衛生行政人員，表揚其濟世救人的崇高精神與胸懷，立法院「厚生會」與衛生福利部共同主辦「國家醫療奉獻獎」，分為個人醫療奉獻獎、特殊醫療貢獻獎及團體醫療奉獻獎三類，每年頒發一次。
本校創校以來持續關懷偏鄉醫療，不僅曾成立山地醫療專班培育山地醫師，許多校友亦秉持杜聰明院長「欲為醫者，必先為人也」之教誨，長期為偏鄉醫療無私奉獻，高醫人榮獲醫奉獎人數高居全國之冠。

1991年至2021年止，本校累計46位得獎者。
2021牛道明
台灣醫療典範獎
中華民國醫師公會全國聯合會自95年開始於醫師節慶祝大會暨醫師醫療奉獻獎與醫師特殊貢獻獎頒獎典禮，表揚「醫師醫療奉獻獎與醫師特殊貢獻獎」，藉由表揚在醫療工作中有特殊貢獻的醫師，來彰顯默默奉獻、堅守崗位、濟世救人的醫者情懷，以期重塑醫師仁心仁術的美好專業形象，爭取社會大眾對醫師的認同與信賴，進而改善醫病關係，提升我國醫療品質，增進民眾健康福祉。

2006年至2021年止，共計31位校友獲此殊榮。
2021 林俊農
2021林鴻
2021 曾競鋒
2021 溫明賢
2021 鐘育志
傑出校友
本校訂定「傑出校友暨榮譽校友選拔辦法」，表揚校友對人類、社會、國家及母校服務之熱忱與貢獻。傑出校友選拔分為四項類別：
一、學術類：有重要發明、著作或論文，成果卓越者。
二、領導者類：主持機構或團體成效卓著並裨益社會，足資表率者。
三、母校貢獻類：對本校之教學、服務、醫療科技創新、捐資興學或發展有特殊貢獻者。
四、社會人類文化貢獻類。

截至2022年5月止，共計162位校友獲獎。
2022 周繡玲
2022 陳建宏
2022 侯明鋒
2022 田英俊
2022 邱啟潤
2022 關皚麗